Ante la inmediata aprobación por parte del Consejo Estatal del Patrimonio Natural y la Biodiversidad de la Instrucción Técnica para el Procedimiento de Comunicación de la Actualizaciones de la Información Oficial de la Red Natura 2000, Aproca ha solicitado a la Consejera de Agricultura y Medio Ambiente de Castilla La Mancha, Maria Luisa Soriano, la modificación de límites e incluso la supresión de algunos Lugares de Interés Comunitario (LICs) y Zonas de Especial Protección para las Aves (ZEPAS) que, a criterio de esta entidad, fueron declarados en su momento sin la base científica suficiente para la elevación de Europa de su aprobación.
Además, Aproca denuncia que la declaración de la Red Natura 2000 se realizó por parte de las comunidades autónomas sin comunicación ni información pública alguna a los propietarios de los terrenos, verdaderos y únicos protagonistas del buen estado de conservación de estos espacios.
Finalmente, desde Aproca se ha trasladado a la Subdirección General de Medio Natural del Ministerio de Agricultura, Alimentación y Medio Ambiente aclaraciones al borrador de la Orden por la que se regula el Procedimiento de Comunicación de la Información Oficial sobre Espacios Protegidos Red Natura 2000, entre las Comunidades Autónomas, la Administración General del Estado y la Comisión Europea, mostrando su preocupación por el retraso que tendrán las resoluciones de proyectos que se encuentren dentro de estos espacios protegidos.